Le Chihuahua est une des plus anciennes races de chien. Les historiens ont démontré leur présence au Mexique lors de fouilles archéologiques dans les ruines des pyramides de Cholula et de Chichen Itza.
Les Chihuahuas auraient été les compagnons des Toltèques au cours du 9ème siècle et étaient utilisés pour des raisons religieuses. Bien qu’on ne sache pas avec certitude quand ils sont apparus, il semblerait qu’ils existaient avant les Mayas. Leurs ancêtres étaient plus grands que ceux que nous connaissons aujourd’hui, ce qui s’expliquerait par des croisements avec une autre race de chien (les chiens chinois à crête).
Le nom de Chihuahua a été donné à cette race car ces chiens ont été découverts dans l’état mexicain du Chihuahua.